[OpenBioMaps] szerver növekedés és átszervezés

[Bérces Sándor]

Kedves Listatagok!

Az OpenBioMaps fejlesztése során már korábban felmerült, hogy szükség lenne
a tárolt fajnevek taxonómiai besorolására és adatbázisban tárolására.

A DINPI adatbázisában eddig nem foglalkoztunk a taxon besorolással, csupán
egy oszloppal bővítettük a fajokat tartalmazó adattáblát, amibe manuálisan
beírtuk, hogy gerinctelen, madár, hal, hüllő, kétéltű, denevér, emlős,
növény.
A gerinces fajokkal kapcsolatban, a legtöbb esetben, ennél finomabb
felbontásra ritkán van szükség, azonban a gerinctelenek esetében ez a
besorolás kevésnek bizonyult. Hamar kiderült, hogy minimum rend (pl.
*Coleoptera*, *Lepidoptera*, *Odonata *stb.) szinten kellene tudni
szétválasztani a tárolt taxonokat. Még jobb lenne persze, ha család szintig
lehetne azonosítani a fajokat. (Néhány ízeltlábú taxonnál a család
meghatározása problémás lehet pl. egyes ormányosbogarak, szúbogarak,
levélbogarak esetében.)

A kérdésem az, hogy szerintetek hogyan lehetne tárolni a fajok rendszertani
besorolását?

Az adatbázis megalkotásánál fontosnak tartottuk, hogy mindenki olyan névvel
rögzíthesse a fajokat amilyennel csak akarja. A szakmai indokunk az volt,
hogy többször fordult elő, hogy visszatért egy régi fajnév, amit már
egyszer invalidnak nyilvánítottak, vagy szétválasztottak fajokat, mely a
névhasználatban valahogy tükröződött. Ennek viszont az a következménye,
hogy tárolnunk kell a szinonimokat. Erre Miki egy nagyon klassz modult
készített, ami -- ha jó értem -- összekapcsolja a neveket egymással és így
mindegy, hogy mely névre keresünk eredményként a keresett taxon 'régi' és
'új' nevével szerelő adatokat egyaránt visszakapjuk. Ezt a modult azonban
közvetlen adatbázis kapcsolat esetén nem tudjuk használni, hiszen ilyenkor
a 'primer' táblát kérdezzük le.

Ehhez kapcsolódó kérdésem: hogyan lehetne megvalósítani, hogy az
OpenBioMaps funkciók elérhetők legyenek mondjuk QGIS-ből közvetlenül is?
Felmerülhet egy QGIS modul készítésének lehetősége?

Korábban Bán Mikivel hosszasan egyeztettünk a taxonómiai témáról és arra
jutottunk, hogy a nemzetközi sztenderdekhez kellene alkalmazkodnunk. Akkor
arra jutottunk, hogy azokat a taxon neveket tekintjük elfogadott (valid)
névnek, melyeket a Catalogue of Life-ban (COL) publikáltak. Reménytelen
feladatnak látszik olyan szakmai kérdésekben konszenzusra jutni, mint
amilyen annak megítélése, hogy mi egy adott faj aktuálisan elfogadott latin
neve. A saját adatbázisunkban nem foglalkoztunk az alfajok kérdésével,
azonban több taxon név is így került be az adatbázisba alfaj névvel együtt.
Jó lenne tudni, hogy más hogyan kezeli ezt a problémát.

Az ehhez kapcsolódó kérdésem, hogy miként lehetne összekapcsolni a saját
név adatbázist a COL-ben tárolt taxon nevekkel? Lehetséges lenne-e a saját
adatbázisunkban használt neveket  és a COL neveit úgy összefésülni, hogy
nem minden esetben a COL álláspontját fogadjuk el?
pl. *Carabus hampei* jelenleg a COL-ben *Carabus (Morphocarabus) rothi
hampei* Küster, 1846 (
http://www.catalogueoflife.org/col/details/species/id/cdfc1d0d46425bc222b17f471bac7578/source/tree)
néven szerepel, a szinonimok között sem találok *C. hampei*-t. Ez a
futóbogár egyébként így *C. hampei*-ként szerepel az EU Élőhelyvédelmi
Itányelv II. sz függelékében.

Kíváncsian várom a javaslatokat észrevételeket.

Üdv:
S

Bérces Sándor
Duna-Ipoly Nemzeti Park Igazgatóság
--------- következő rész ---------
Egy csatolt HTML állomány át lett konvertálva...
URL: <http://lists.openbiomaps.org/pipermail/biomaps/attachments/20161123/faafe876/attachment.html>