[OpenBioMaps] OBM 2021 -> 2022

Bán Miklós banm at vocs.unideb.hu
Sat Jan 1 10:15:43 CET 2022


=====================
For english text, scroll down...

=====================


Kedves kollégák, kedves barátaim,

Az új esztendő első napján szeretnék köszönetet mondani mindenkinek az 
OBM támogatásáért (mondjuk az elmúlt egy évre, vagy az össze eddigi évre 
is).

Az épülő és erősödő OBM felhasználó közösségnek köszönhetően a tavalyi 
évben rengeteget fejlődött a terepi adatgyűjtő mobil alkalmazásunk. 
Lehet nyomvonalat rögzíteni vele, poligont felvenni és lehet esemény 
listákat készíteni egyszeri rögzítésű adatokkal. Ezek mind olyan 
funkciók, amelyek a professzionális terepi adatgyűjtés kellékei.

Nem véletlenül kerültek ezek a fejlesztések a fókuszba. 2021-ben az OBM 
fejlődésének homlokterében a kutatás támogatás volt, aminek ez első 
lépése a profi terepi mintavételezések támogatása. Ezeket a fejlesztések 
még az idén is folytatni fogjuk. Szeretném például, hogy, ha a 
feltételes mezőkapcsolatok kezelése is bekerülne a mobil alkalmazásba 
is, vagy az adatok terepi online lekérdezhetősége.

Az új funkciók fejlesztése mellett pedig folyamatos feladatokat adott az 
egész mobilos világ fejlődése, ami miatt meglévő funkciókat az év során 
többször is újra kellett írni és ez az idén sem lesz másképp. Azaz 
minden új funkció megjelenése kb 3szoros fejlesztési energia 
befektetéssel jár.

A kutatás támogatás eszközei az adatgyűjtő eszközök fejlesztésén túl is 
bővültek. Például most már lehet külső adatrepozitóriumokat használni 
adatcsomagok független tárolására és tartós azonosítók hozzárendelésére, 
amely eszköz jelentősen megkönnyítheti a publikációs folyamatban a 
kötelezően megosztandó adatok elhelyezését, publikálását és DOI 
hozzárendelést. Az webes alkalmazás és az OBM R csomagja is támogatja a 
repozitórium kezelő eszközeit.

Sokat és eredményesen dolgoztunk az OBM szerverek karbantarthatóságának 
javításáért. Ennek azért van jelentősége, mert arra törekszünk, hogy a 
központi fejlesztő csapat aktív támogatása nélkül is létre lehessen 
hozni és üzemeltetni lehessen új OBM szervereket. Létre is jött idén öt 
új szerver öt új felhasználó intézmény gondozásában. Az új intézmények, 
azaz az új nagy felhasználók minden alkalommal jelentős lendületet adnak 
az OBM fejlődéséhez, részben az új igények megfogalmazásával részben 
pedig a fejlesztések anyagi támogatásával.

Egy kis csapattal dolgozunk az OBM-hez kapcsolódó adatfeltáró eszközök 
fejlesztésén. Ez azt jelenti, hogy beépítettünk az OBM szerverekről 
elérhető adatelemző és ábrakészítő felületet, amelynek használatával 
nagyon kényelmessé tudjuk tenni a teljes adatbázis alapos áttekintését 
(pl. eloszlások és kiugró értékek interaktív ábrázolása, összefoglalók 
készítése). Ennek egy működő ( fejlesztői ) prototípusa megtekinthető az 
openbiomaps.org szerver felhasználói számára itt: 
http://rshiny.openbiomaps.org/ <http://rshiny.openbiomaps.org/>

További kutatási eszközök integrálását is tervezzük, amelyekkel 
egyszerűsíteni lehet az online együttműködő elemző munkát. Szintén 
tervezzük az OBM alap adatbázis struktúrájának az átalakítását is, 
aminek köszönhetően egyszerűbbé fog válni a nagy adattömegek (> 2millió 
rekord) és a komplex adatstruktúrák kezelése.

Az év végére megújult az OBM arculata is. Kaptunk új logót, ami a 
következő pár hónapban mindenhol le fogja cserélni a különféle régieket. 
Az új logó képeket itt megnézhetitek előre: 
https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing 
<https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing> 


Sokat dolgozunk az OBM dokumentációk fejlesztésén is, amit még mindig 
nagyon sokat kell fejleszteni, hogy valóban minden területen segítse a 
felhasználókat és projekt gazdákat. Számomra ez az egyik legfontosabb 
feladat az idei évre, mert most már elég nyilvánvalóan nem győzöm a 
személyes segítség nyújtást, hiába szeretem nagyon. Úgyhogy ez úton is 
bocsánatot kérek mindenkitől aki hetek vagy hónapok óta vár bizonyos 
feladatokban való támogatásra. Törekszem rá, hogy különféle 
dokumentációk írása és kurzusok formájában a legtöbb támogatást tudjam 
nyújtani a közösségnek és persze igyekszem, hogy a személyes 
segítségeket továbbra is megadni, de azt nem ígérem, hogy hatékonyabb 
lesz mint eddig, úgyhogy kérlek bátran kérdezzetek egymástól, 
használjátok a levelezési listákat, írjatok dokumentációkat, készítsetek 
tutoriálokat!

Jelentős késéssel szeretném megosztani veletek a szaporcai találkozó 
elkészített videó felvételeit (https:// 
www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7 
<https://www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7>) 
és felhívni a figyelmeteket az ökoszisztéma alaptérkép használatáról 
szóló kérdőívre 
(https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/ 
<https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/>) 
amit szintén Szaporcán ígértem, hogy megosztom.


Boldog új évet mindenkinek!


üdv, Miki


============================


Dear colleagues, dear friends,

On the first day of the new year, I would like to thank you all for your 
support to OBM (for the past year, or all the years so far).

Thanks to the building and strengthening OBM user community, our field 
data collection mobile app has grown tremendously over the past year. 
You can record tracks with it, record polygons, and you can create event 
lists with fixed fields. These are all features that are essential for 
professional field data collection.

It's no coincidence that these enhancements have come into focus. In 
2021, research support was at the forefront of OBM's development, with 
the first step being support for professional field sampling. These 
developments will continue this year. I would like, for example, to see 
the management of conditional field relationships included in the mobile 
app, or the ability to query data online in the field.

In addition to the development of new features, the evolution of the 
mobile world as a whole has given us a constant challenge, which has 
meant that existing features have had to be rewritten several times 
during the year and this year will be no different. That is, each new 
feature release requires an investment of about 3 times the development 
energy.

Research support tools have been extended beyond the development of data 
collection tools. For example, it is now possible to use external data 
repositories to store data packages independently and assign persistent 
identifiers, a tool that can greatly facilitate the process of mandatory 
data sharing, publication and DOI assignment in the publication process. 
The web application and OBM R package also support repository management 
tools.

We have worked hard and effectively to improve the maintainability of 
OBM servers. This is important because we are working to enable new OBM 
servers to be created and operated without the active support of the 
central development team. Five new servers have been created this year 
under the care of five new user institutions. New institutions, i.e. new 
large users, always give a significant boost to the development of OBM, 
partly by creating new needs and partly by financially supporting the 
development.

A small team is working on the development of data discovery tools for 
OBM. This means that we have built in a data analysis and plotting 
interface accessible from the OBM servers, which we can use to make it 
very convenient to have a thorough overview of the whole database (e.g. 
interactive plotting of distributions and outliers, creating summaries). 
A working ( developer ) prototype of this can be accessed by users of 
the openbiomaps.org server here: http://rshiny.openbiomaps.org/ 
<http://rshiny.openbiomaps.org/>

We also plan to integrate additional research tools to simplify online 
collaborative analysis work. We also plan to redesign the basic OBM 
database structure, which will make it easier to handle large data sets 
(> 2million records) and complex data structures.

By the end of the year, OBM's design was also renewed. We have a new 
logo which will replace the various old ones everywhere in the next few 
months. You can preview the new design images here: 
https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing 
<https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing> 


We are also working a lot on the development of the OBM documentation, 
which still needs a lot of improvement to really help users and project 
owners in all areas. For me, this is one of the most important tasks for 
this year, because now it's pretty obvious that I can't provide more 
personal support, even though I love it very much. So I apologise to all 
of you who have been waiting for weeks or months for support with 
certain tasks. I will endeavour to provide as much support as I can to 
the community by writing various documentation and tutorials, and of 
course I will try to continue to provide personal help, but I can't 
promise that it will be any more effective than it has been, so please 
feel free to ask each other, use the mailing lists, write documentation 
and tutorials!

After a considerable delay, I would like to share with you the video 
footage of the meeting in Szaporca (https:// 
www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7 
<https:// 
www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7>) and 
draw your attention to the questionnaire on the use of the ecosystem 
basemap 
(https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/ 
<https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/>) 
that I promised to share also in Szaporca.


Happy New Year everyone!


Best regards, Miki



-- 
Miklós Bán, PhD
MTA-DE Behavioural Ecology Research Group
Department of Evolutionary Zoology, University of Debrecen
H-4010 Debrecen, Egyetem tér 1.
Phone:  +36 52 512-900 ext. 62357
http://zoology.unideb.hu/@Miklos_Ban

OpenBioMaps
https://openbiomaps.org
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.openbiomaps.org/pipermail/biomaps/attachments/20220101/1573d36a/attachment.htm>


More information about the Biomaps mailing list