[OpenBioMaps] OBM 2021 -> 2022
Bán Miklós
banm at vocs.unideb.hu
Sat Jan 1 10:15:43 CET 2022
=====================
For english text, scroll down...
=====================
Kedves kollégák, kedves barátaim,
Az új esztendő első napján szeretnék köszönetet mondani mindenkinek az
OBM támogatásáért (mondjuk az elmúlt egy évre, vagy az össze eddigi évre
is).
Az épülő és erősödő OBM felhasználó közösségnek köszönhetően a tavalyi
évben rengeteget fejlődött a terepi adatgyűjtő mobil alkalmazásunk.
Lehet nyomvonalat rögzíteni vele, poligont felvenni és lehet esemény
listákat készíteni egyszeri rögzítésű adatokkal. Ezek mind olyan
funkciók, amelyek a professzionális terepi adatgyűjtés kellékei.
Nem véletlenül kerültek ezek a fejlesztések a fókuszba. 2021-ben az OBM
fejlődésének homlokterében a kutatás támogatás volt, aminek ez első
lépése a profi terepi mintavételezések támogatása. Ezeket a fejlesztések
még az idén is folytatni fogjuk. Szeretném például, hogy, ha a
feltételes mezőkapcsolatok kezelése is bekerülne a mobil alkalmazásba
is, vagy az adatok terepi online lekérdezhetősége.
Az új funkciók fejlesztése mellett pedig folyamatos feladatokat adott az
egész mobilos világ fejlődése, ami miatt meglévő funkciókat az év során
többször is újra kellett írni és ez az idén sem lesz másképp. Azaz
minden új funkció megjelenése kb 3szoros fejlesztési energia
befektetéssel jár.
A kutatás támogatás eszközei az adatgyűjtő eszközök fejlesztésén túl is
bővültek. Például most már lehet külső adatrepozitóriumokat használni
adatcsomagok független tárolására és tartós azonosítók hozzárendelésére,
amely eszköz jelentősen megkönnyítheti a publikációs folyamatban a
kötelezően megosztandó adatok elhelyezését, publikálását és DOI
hozzárendelést. Az webes alkalmazás és az OBM R csomagja is támogatja a
repozitórium kezelő eszközeit.
Sokat és eredményesen dolgoztunk az OBM szerverek karbantarthatóságának
javításáért. Ennek azért van jelentősége, mert arra törekszünk, hogy a
központi fejlesztő csapat aktív támogatása nélkül is létre lehessen
hozni és üzemeltetni lehessen új OBM szervereket. Létre is jött idén öt
új szerver öt új felhasználó intézmény gondozásában. Az új intézmények,
azaz az új nagy felhasználók minden alkalommal jelentős lendületet adnak
az OBM fejlődéséhez, részben az új igények megfogalmazásával részben
pedig a fejlesztések anyagi támogatásával.
Egy kis csapattal dolgozunk az OBM-hez kapcsolódó adatfeltáró eszközök
fejlesztésén. Ez azt jelenti, hogy beépítettünk az OBM szerverekről
elérhető adatelemző és ábrakészítő felületet, amelynek használatával
nagyon kényelmessé tudjuk tenni a teljes adatbázis alapos áttekintését
(pl. eloszlások és kiugró értékek interaktív ábrázolása, összefoglalók
készítése). Ennek egy működő ( fejlesztői ) prototípusa megtekinthető az
openbiomaps.org szerver felhasználói számára itt:
http://rshiny.openbiomaps.org/ <http://rshiny.openbiomaps.org/>
További kutatási eszközök integrálását is tervezzük, amelyekkel
egyszerűsíteni lehet az online együttműködő elemző munkát. Szintén
tervezzük az OBM alap adatbázis struktúrájának az átalakítását is,
aminek köszönhetően egyszerűbbé fog válni a nagy adattömegek (> 2millió
rekord) és a komplex adatstruktúrák kezelése.
Az év végére megújult az OBM arculata is. Kaptunk új logót, ami a
következő pár hónapban mindenhol le fogja cserélni a különféle régieket.
Az új logó képeket itt megnézhetitek előre:
https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing
<https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing>
Sokat dolgozunk az OBM dokumentációk fejlesztésén is, amit még mindig
nagyon sokat kell fejleszteni, hogy valóban minden területen segítse a
felhasználókat és projekt gazdákat. Számomra ez az egyik legfontosabb
feladat az idei évre, mert most már elég nyilvánvalóan nem győzöm a
személyes segítség nyújtást, hiába szeretem nagyon. Úgyhogy ez úton is
bocsánatot kérek mindenkitől aki hetek vagy hónapok óta vár bizonyos
feladatokban való támogatásra. Törekszem rá, hogy különféle
dokumentációk írása és kurzusok formájában a legtöbb támogatást tudjam
nyújtani a közösségnek és persze igyekszem, hogy a személyes
segítségeket továbbra is megadni, de azt nem ígérem, hogy hatékonyabb
lesz mint eddig, úgyhogy kérlek bátran kérdezzetek egymástól,
használjátok a levelezési listákat, írjatok dokumentációkat, készítsetek
tutoriálokat!
Jelentős késéssel szeretném megosztani veletek a szaporcai találkozó
elkészített videó felvételeit (https://
www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7
<https://www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7>)
és felhívni a figyelmeteket az ökoszisztéma alaptérkép használatáról
szóló kérdőívre
(https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/
<https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/>)
amit szintén Szaporcán ígértem, hogy megosztom.
Boldog új évet mindenkinek!
üdv, Miki
============================
Dear colleagues, dear friends,
On the first day of the new year, I would like to thank you all for your
support to OBM (for the past year, or all the years so far).
Thanks to the building and strengthening OBM user community, our field
data collection mobile app has grown tremendously over the past year.
You can record tracks with it, record polygons, and you can create event
lists with fixed fields. These are all features that are essential for
professional field data collection.
It's no coincidence that these enhancements have come into focus. In
2021, research support was at the forefront of OBM's development, with
the first step being support for professional field sampling. These
developments will continue this year. I would like, for example, to see
the management of conditional field relationships included in the mobile
app, or the ability to query data online in the field.
In addition to the development of new features, the evolution of the
mobile world as a whole has given us a constant challenge, which has
meant that existing features have had to be rewritten several times
during the year and this year will be no different. That is, each new
feature release requires an investment of about 3 times the development
energy.
Research support tools have been extended beyond the development of data
collection tools. For example, it is now possible to use external data
repositories to store data packages independently and assign persistent
identifiers, a tool that can greatly facilitate the process of mandatory
data sharing, publication and DOI assignment in the publication process.
The web application and OBM R package also support repository management
tools.
We have worked hard and effectively to improve the maintainability of
OBM servers. This is important because we are working to enable new OBM
servers to be created and operated without the active support of the
central development team. Five new servers have been created this year
under the care of five new user institutions. New institutions, i.e. new
large users, always give a significant boost to the development of OBM,
partly by creating new needs and partly by financially supporting the
development.
A small team is working on the development of data discovery tools for
OBM. This means that we have built in a data analysis and plotting
interface accessible from the OBM servers, which we can use to make it
very convenient to have a thorough overview of the whole database (e.g.
interactive plotting of distributions and outliers, creating summaries).
A working ( developer ) prototype of this can be accessed by users of
the openbiomaps.org server here: http://rshiny.openbiomaps.org/
<http://rshiny.openbiomaps.org/>
We also plan to integrate additional research tools to simplify online
collaborative analysis work. We also plan to redesign the basic OBM
database structure, which will make it easier to handle large data sets
(> 2million records) and complex data structures.
By the end of the year, OBM's design was also renewed. We have a new
logo which will replace the various old ones everywhere in the next few
months. You can preview the new design images here:
https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing
<https://drive.google.com/drive/folders/1PnmDy0NTleC5VttXXkR_JdwsLsvyPRgT?usp=sharing>
We are also working a lot on the development of the OBM documentation,
which still needs a lot of improvement to really help users and project
owners in all areas. For me, this is one of the most important tasks for
this year, because now it's pretty obvious that I can't provide more
personal support, even though I love it very much. So I apologise to all
of you who have been waiting for weeks or months for support with
certain tasks. I will endeavour to provide as much support as I can to
the community by writing various documentation and tutorials, and of
course I will try to continue to provide personal help, but I can't
promise that it will be any more effective than it has been, so please
feel free to ask each other, use the mailing lists, write documentation
and tutorials!
After a considerable delay, I would like to share with you the video
footage of the meeting in Szaporca (https://
www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7
<https://
www.youtube.com/playlist?list=PLNTYuxQvJcSYJOSXZewui6h4tqHEuTjf7>) and
draw your attention to the questionnaire on the use of the ecosystem
basemap
(https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/
<https://termeszetvedelem.hu/kerdoiv-az-okoszisztema-alapterkeprol/>)
that I promised to share also in Szaporca.
Happy New Year everyone!
Best regards, Miki
--
Miklós Bán, PhD
MTA-DE Behavioural Ecology Research Group
Department of Evolutionary Zoology, University of Debrecen
H-4010 Debrecen, Egyetem tér 1.
Phone: +36 52 512-900 ext. 62357
http://zoology.unideb.hu/@Miklos_Ban
OpenBioMaps
https://openbiomaps.org
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.openbiomaps.org/pipermail/biomaps/attachments/20220101/1573d36a/attachment.htm>
More information about the Biomaps
mailing list